Antes o después de ciertas migraciones podemos cambiar el nivel de compatibilidad SQL con el motor instalado. Si desconocemos la versión, podemos obtenerlas con la siguiente consulta:

SELECT SERVERPROPERTY('ProductVersion');  

Así como el nivel actual de las bases de datos:

SELECT name, compatibility_level FROM sys.databases;

Para realizar el cambio a todas, excepto las 4 primeras del sistema:

declare @nivel_compatible  varchar(max)
set     @nivel_compatible  = ''
select  @nivel_compatible = @ nivel_compatible +

from   sys.databases
where  database_id > 4 and compatibility_level not in ('100')
exec   (@ nivel_compatible)

En este ejemplo cambiaríamos el nivel de compatibilidad de las que no son 100 a 100, jugando con la clausula WHERE de la instrucción podemos realizar los cambios que necesitemos.

 

Fuente: Diferencias entre niveles de compatibilidad